清正公吉祥加持祈祷会とその後に行われる縁日のお祭りを清正公祭りと呼びます。
清運寺本堂で日蓮宗修法師による祈祷法要が受けられ、希望の方は祈祷の木札を申し込んでおきます。事前申し込みと当日申し込みの両方があります。
祈祷は、家内安全、商売繁盛、安産成就、当病平癒、交通安全、厄除け開運など家族の幸せから仕事向け、子供向けなどさまざまな目的で受けることができます。交通安全には木札の他に車載用お守りが付くので、車輛番号を記載して申し込みます。

祈祷後、境内で二胡の演奏があり、涼し気な癒しのメロディーを聴きながら縁日が始まります。
縁日は、境内で行われる家庭的なもの。かき氷や焼きそば、ヨーヨー釣りなどの屋台が出て、まるで親戚たちの集まりのような雰囲気が楽しめます。