薬師堂例祭が開催される藥師寺は、天武天皇が建立した名残の一部で、現在でも当時の天皇家の状況が分かる資料が納められています。
また天武天皇の存在はご利益があると伝承されているので、記念日を制定して参列者にご利益を得られるようにしたのが現在の薬師堂例祭です。

ご利益は商業的な意味も含まれているので屋台の出店数も多く、中には限定品を制作して販売しているお店もある為、一つの産業が成り立つ程の文化になっています。